原理是混合气体中的各种成分通过色谱柱的速度不同。气相色谱厂家分子的紫外可见吸收光谱是由于分子中的某些基团吸收了紫外可见辐射光后，发生了电子能级跃迁而产生的吸收光谱。它是带状光谱，反映了分子中某些基团的信息。GC-7960Ⅱ气相色谱可以用标准光谱图再结合其它手段进行定性分析。可以用三种农药的波长在某溶液中的大、小吸收波长。

使用有效国产气相色谱仪试剂和新蒸二次蒸馏水作流动相，气相色谱厂家所使用的溶剂其截止波长一定要低于检测波长，对不是HPLC级的试剂要进行过滤（HPLC试剂出厂前已用0.02μm滤膜过滤）。对流动相一定要脱气。GC-7960Ⅱ气相色谱检测器输出与积分仪（处理机）要匹配，要合理设置参数如斜率、半峰宽、阈值、AUFS值、衰减等。将适宜的进样量和合适的参数结合起来，使主峰峰高达到记录仪满量程的80%左右。

开机前应先打开空压机、氢气发生器等设备，检查各路气源，使其在面板上的压力表显示，气相色谱厂家指示到正常工作所要求的压力值。快速气相色谱仪开机后须预热90分钟，以达到佳工作状态。“注样口”按钮，GC-7960Ⅱ气相色谱正常工作时应处于按下状态，快速气相色谱仪一旦调试好之后，在正常工作时不能随意调节温度、压力等参数。关机时，先退出联机程序，关闭快速气相色谱仪电源，再关闭空压机、氢气发生器等设备。

电器方面的原因：首先将检测器信号线断开，气相色谱厂家在采集状态下观察基线运行情况，如果基线波动很大则可判断该故障是电器方面的原因，此时，需要进一步检查仪器接地是否良好、线路板及各插件是否松动等。测量系统污染：断开信号线后，在采集状态下检查基线运行的情况，GC-7960Ⅱ气相色谱如果基线运行正常则证明测量系统污染。需要检查色谱柱是否失效（需活化处理）、柱进口是否污染。

高灵敏度操作气相色谱仪未稳定之前；操作气相色谱仪TCD、ECD时，气相色谱厂家柱箱或检测器箱温度周期变化；环境温度对气相色谱仪控温影响；GC-7960Ⅱ气相色谱电压不稳，对气相色谱仪柱温控制精度影响；过温保护设置低于气相色谱仪控制温度；6.压力(流量)调节阀失调，周期变化。