使用有效国产气相色谱仪试剂和新蒸二次蒸馏水作流动相，色谱仪厂家所使用的溶剂其截止波长一定要低于检测波长，对不是HPLC级的试剂要进行过滤（HPLC试剂出厂前已用0.02μm滤膜过滤）。对流动相一定要脱气。GC-7960Ⅱ色谱仪检测器输出与积分仪（处理机）要匹配，要合理设置参数如斜率、半峰宽、阈值、AUFS值、衰减等。将适宜的进样量和合适的参数结合起来，使主峰峰高达到记录仪满量程的80%左右。

仪器内部的吹扫、清洁气相色谱仪停机后，打开仪器的侧面和后面面板，用仪表空气或氮气对仪器内部灰尘进行吹扫，对积尘较多或不容易吹扫的地方用软毛刷配合处理。色谱仪厂家吹扫完成后，对仪器内部存在有机物污染的地方用水或有机溶剂进行擦洗，GC-7960Ⅱ色谱仪对水溶性有机物可以先用水进行擦拭，对不能完全清洁的地方可以再用有机溶剂进行处理，对非水溶性或可能与水发生化学反应的有机物用不与之发生反应的有机溶剂进行清洁，如甲苯、丙酮、四氯化碳等。注意，在擦拭仪器过程中不能对仪器表面或其他部件造成腐蚀或二次污染。

造成峰丢失的原因有两种：一是气路中有污染，另一可能是峰没有分开。色谱仪厂家一种情况可通过多次空运行和清洗气路（进样口、检测器等）来解决。为了减少对气路的污染，可采用以下的措施：程序升温的后阶段应有一个高温清洗过程；GC-7960Ⅱ色谱仪注入进样口的样品应当清洁；减少高沸点的油类物质的使用；使用尽量高的进样口温度、柱温和检测器温度。

载气系统。气相色谱仪中的气路是一个载气连续运行的密闭管路系统。色谱仪进样系统。进样就是把气体或液体样品速而定量地加到色谱柱上端。分离系统。分离系统的核心是色谱柱，它的作用是将多组分样品分离为单个组分。检测系统。检测器的作用是把被色谱柱分离的样品组分根据其特性和含量转化成电信号，经放大后，由记录仪记录成色谱图。信号记录或微机数据处理系统。近年来气相色谱仪主要采用色 谱数据处理机。温度控制系统。用于控制和测量色谱柱、检测器。GC-7960Ⅱ色谱仪气化室温度，是气相色谱仪的重要组成部分。