开机前应先打开空压机、氢气发生器等设备，检查各路气源，使其在面板上的压力表显示，色谱仪公司指示到正常工作所要求的压力值。快速气相色谱仪开机后须预热90分钟，以达到佳工作状态。“注样口”按钮，GC-7960Ⅱ色谱仪正常工作时应处于按下状态，快速气相色谱仪一旦调试好之后，在正常工作时不能随意调节温度、压力等参数。关机时，先退出联机程序，关闭快速气相色谱仪电源，再关闭空压机、氢气发生器等设备。

气相色谱仪对温度环境的要求并不特殊，一般在5～35℃的室温条件下即可满足操作要求，色谱仪公司对于湿度环境一般要求在20%～85%为宜。GC-7960Ⅱ色谱仪在高湿度的地区，使用某些型号的气相色谱仪价格时，会因为环境湿度大而导致气相色谱仪的绝缘性能下降，若在高灵敏度挡位操作响应值则会下降。工作人员在使用气相色谱仪时遇到上述现象应该采取必要的措施。

使用稳定：使用时气压低，关机后残余气量少，并有过压保护装置，使用过程稳定度较高；色谱仪公司操作方便：随开随关，免除搬运之苦，一劳永逸；GC-7960Ⅱ色谱仪成本低廉：氢气发生器使用过程中只消耗蒸馏水，大功率150VA；氮气发生器只消耗空气（需另接空气源），大功率100VA；结构紧凑：外观优美，占地面积小，使实验室实现仪器化。

使用有效国产气相色谱仪试剂和新蒸二次蒸馏水作流动相，色谱仪公司所使用的溶剂其截止波长一定要低于检测波长，对不是HPLC级的试剂要进行过滤（HPLC试剂出厂前已用0.02μm滤膜过滤）。对流动相一定要脱气。GC-7960Ⅱ色谱仪检测器输出与积分仪（处理机）要匹配，要合理设置参数如斜率、半峰宽、阈值、AUFS值、衰减等。将适宜的进样量和合适的参数结合起来，使主峰峰高达到记录仪满量程的80%左右。